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CyRISBio collabore avec DiData pour offrir une solution logicielle dédiée à la gestion d'échantillons

Une revue publiée en 2026 montre que, en dépit des grands progrès réalisés par les biobanques, les pratiques restent très hétérogènes : dans de nombreuses institutions, la gestion manuelle et le suivi sur papier sont toujours prévalents. Un problème couramment rencontré est d’avoir, d'un côté un logiciel de stockage qui sait où se trouve l'échantillon et, de l'autre, des données d'essais cliniques qui décrivent ses caractéristiques mais sans que ces deux types d’informations soient facilement reliées.

Ce fossé illustre l’un des défis que l’automatisation des laboratoires cherche à relever : connecter dans un flux numérique continu un système d'orchestration centralisé, des équipements, des systèmes robotiques et des données.  C'est dans cette dynamique que s'inscrit le partenariat entre CyRISBio et DiData. Il nous permet de répondre aux grands enjeux de la gestion des échantillons : la traçabilité, la précision, l'efficacité et la sécurité.

Pourquoi nous avons choisi ce partenariat avec DiData

DiData est un acteur spécialisé dans le développement de logiciels, dont la flexibilité complète parfaitement notre expertise en automatisation sur mesure. Ce choix repose sur trois éléments clés :

-       Un module conçu avec les utilisateurs. DiData a co-développé son module biobanque, SMPL, avec la Swiss Biobanking Platform, un réseau national fédérant les biobanques suisses selon des standards harmonisés au niveau international. Depuis, le logiciel a aussi été déployé dans des centres de ressources biologiques de référence en France (CHU d'Amiens et CHU de Marseille).

-       Un Système de gestion de l’information du laboratoire (LIMS) modulaire prêt à l'emploi. Le logiciel guide intuitivement les utilisateurs, étape par étape, et s'adapte à l'évolution des besoins de la biobanque.

-       Un modèle économique compatible avec les budgets académiques et hospitaliers. Une licence annuelle par utilisateur, mises à jour incluses, sans rachat de licence à chaque version. La solution s'adapte aussi bien aux petits volumes d'échantillons qu'aux grandes biobanques.

Un logiciel personnalisable pour une traçabilité complète

Dans les laboratoires modernes, l'efficacité vient du logiciel qui orchestre intelligemment les différents équipements. Sur la plateforme DiData, il est possible de créer ses workflows dans un éditeur visuel, sans avoir à écrire une seule ligne de code. Grâce à son architecture modulaire et interopérable, le logiciel peut être étendu selon les besoins de chaque projet. Dès le premier jour, le client dispose d'un outil conçu pour lui.

Une seule interface permet de gérer les échantillons et de piloter les études cliniques. Pour chaque échantillon, le système enregistre des paramètres tels que l'identité, l'état physique, la quantité disponible, la localisation, ainsi que le consentement du donneur et les conditions d'utilisation associées. À titre d’exemple, un responsable de biobanque peut voir d'un seul coup d'œil quel pourcentage d’une collection d’échantillons a déjà été utilisé.

Comment cela fonctionne-t-il en pratique ? Lorsqu'un échantillon est retiré d'un congélateur connecté, le lecteur de code-barres ou de QR code transmet l'information à la plateforme, qui le rattache à la cohorte ou à l'étude clinique concernée. Il n'est plus nécessaire de ressaisir les données manuellement : chaque manipulation est enregistrée dans un historique associé à l'utilisateur, à la date et au contexte de l'action. DiData va même plus loin en proposant une reconstitution en 3D du congélateur, tiroir par tiroir, boîte par boîte, ce qui permet de retrouver un échantillon précis en s'y « promenant » virtuellement. Il surveille aussi les températures en temps réel et alerte automatiquement en cas d'anomalie.

Pour votre biobanque : une offre complète autour du sample management

La gestion de vos échantillons commence au moment où l'échantillon est mis en tube, étiqueté, et rangé. CyRISBio couvre cette chaîne physique grâce à ses solutions de robotique et d’automatisation de laboratoire, à ses incubateurs et hôtels de stockage et à sa gamme SAFE (Store Aliquots For Ever) : tubes 2D 100% testés (IATA), marquage durable, racks SBS automatisables, tube presenter, systèmes de capping/decapping à couple maîtrisé, lecture 2D.

Avec DiData, CyRISBio assure la continuité entre ce monde physique et le monde numérique de l'échantillon. Nous assurons le déploiement de la plateforme DiData et le lien entre vos instruments, le tout avec un support de proximité en France. La reprise de vos données existantes (fichiers Excel, registres papier ou LIMS actuel) fait partie du périmètre : nous en analysons le volume et la qualité lors du cadrage, avant toute mise en production.

Une fois déployé, un laboratoire connecté présente trois avantages clés :

·      Moins d’erreurs, plus de fiabilité. Les informations sont saisies une fois et circulent entre équipements et LIMS, limitant les ressaisies, erreurs de localisation et fichiers dispersés.

·      Une traçabilité continue, prête pour la qualité. Chaque échantillon conserve son identité, sa localisation, son statut, ses mouvements et son lien avec la cohorte ou l'étude, pour documenter les processus, soutenir les exigences BPF et 21 CFR Part 11 et faciliter les audits.

·      Des équipes plus efficaces. Recherche d’échantillons, suivi des stocks et requêtes sur les cohortes sont accélérés, libérant du temps pour la gestion des collections et les études.

L'impact varie selon votre profil, mais le principe reste le même : un LIMS accessible et personnalisable, intégré sur du matériel fiable et automatisable.

Votre profil ce que le partenariat signifie pour vous

Petite biobanque académique => Accès à un LIMS industriel sans budget excessif, déploiement rapide, paramétrage et support CyRISBio en France

Biobanque hospitalière avec études cliniques (en préparation d'une certification NF S96-900 ou ISO 20387) => Cohortes et échantillons réunis sur une seule plateforme, requêtes multicritères en quelques minutes, historique des opérations et exports structurés facilitant la préparation des audits

Réseau multi-sites => Matériel existant et sites connectés sur une même plateforme, fin de la ressaisie manuelle, vue consolidée des stocks et montée en puissance progressive.

Prêt à faire évoluer votre biobanque ? Vous voulez réduire le coût et le temps de recherche d'un échantillon pour répondre à une demande de faisabilité en quelques minutes plutôt qu'en plusieurs jours ?

Notre équipe analyse avec vous vos collections, vos équipements, vos outils de gestion et vos besoins liés aux études cliniques afin de déterminer si une approche d'automatisation est adaptée à votre environnement.

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Foire aux Questions

Voit notre FAQ

Quel délai moyen entre le premier contact et une solution finale livrée ?

Le délai moyen pour de petites automatisations est autour de 3 mois. Pour des automatisations de laboratoire plus complexes cela varie entre 4 et 10 mois, avec 6 mois en moyenne.

CyRISBio est-elle partenaire de fabricants spécialisés pour ses solutions de pipetage ?

Oui, CyRISBio distribue notamment les plateformes de pipetage automatisé CyBio d'Analytik Jena, utilisées pour le liquid handling en laboratoire.

Que recouvre l'offre de gestion des échantillons (sample management) de CyRISBio ?

L'offre de gestion des échantillons couvre le stockage automatisé à basse température (biobanques), les incubateurs et hôtels de stockage, ainsi que les consommables associés comme les microtubes et racks compatibles, notamment via le partenaire LVL-Technologies.

En quoi consiste l'offre d'automatisation de laboratoire de CyRISBio ?

CyRISBio propose des solutions d'automatisation pour le pipetage et la distribution de liquides, ainsi que l'intégration de plateformes robotisées pour automatiser des workflows complets en laboratoire, en s'appuyant notamment sur les plateformes de pipetage CyBio d'Analytik Jena.

CyRISBio fabrique-t-elle son propre matériel ou distribue-t-elle des marques partenaires ?

CyRISBio conçoit certaines solutions sur-mesure et distribue également des équipements de fabricants spécialisés reconnus dans l'automatisation de laboratoire, afin de proposer à ses clients la solution la plus adaptée à leurs contraintes de process.

Quels secteurs d'activité CyRISBio accompagne-t-elle ?

CyRISBio accompagne des laboratoires dans plusieurs secteurs : pharmaceutique, cosmétique, chimie, agroalimentaire et biologie, avec des solutions d'automatisation adaptées à chaque type de process.

Qui est CyRISBio ?

CyRISBio est une société française spécialisée dans l'automatisation de laboratoire, fondée en 1999. Basée à Chaponost, dans la région lyonnaise, elle conçoit et distribue des solutions robotisées et instrumentées pour le pipetage et la gestion des échantillons en laboratoire.

Nous souhaitons automatiser un process manuel mais nous avons des doutes techniques sur nos workflows, pouvons nous réaliser un POC avec vous ?

Oui. Effectivement le passage d'un process manuel de laboratoire vers un process automatisé peut soulever un certains nombre de questions et de problèmes. Nous travaillerons à fournir des sous-éléments d'automatisation pour lever ces questions. Cela fera l'objet de micro-développements qui consolideront la solution finale.

La mise en relation avec vos ingénieurs projets pour évaluer une solution à notre problématique d'automatisation a t'elle un coût ?

Non ! La première réunion d'échange à souvent lieu par visio conférence. Cela permet rapidement et facilement de se présenter et d'évaluer l'intérêt commun de continuer ensemble. Si les 2 parties décident de travailler ensemble, alors l'ingénieur projet démarre et la facturation se traduit par la prise de commande en cas de succès de l'opération.

Faut-il un cahier des charges détaillé pour démarrer un projet d'automatisation ?

Plus le cahier des charges sur les besoins d'automatisation de votre laboratoire est détaillé, moins cela laisse de la place à notre créativité. L'idéal est de bien définir vos besoins et de bien détailler vos process, le cahier des charges final sera établi après quelques aller-retour avec l'ingénieur projet en charge.

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Peut-on mixer les formats de tubes dans une Biobank de stockage d'échantillons automatisée ?

Oui en effet. Il est possible de mixer au sein du système de stochage d'échantillons automatisé plusieurs types de cassettes de hauteurs différentes. Ainsi on peut mixer aussi bien des tout petits tubes de 300 µL que des tubes de 2 mL.

Quelle est la plus grosse capacité de votre Biobank à -80°C ?

LiCONiC construit à la demande la Biobank en fonction de la capacité nécessaire. Il n'y a aucune limite de capacité. Parmi les systèmes déjà produits on pourra citer par exemple le STC 101k0-ULT.

Ce système de stockage automatisé d'échantillons à -80°C à une capacité de 3.6 M de tubes de 1 mL soit 38400 rack de 96 tubes. En mettant des racks de haute densité HD, la capacité est augmentée de plus de 40% pour atteindre 5,5 M de tubes.

Quelle est la plus petite capacité de votre Biobank à -80°C ?

Le plus petit système de stockage automatisé d'échantillons à -80°C, le STT 1.5K ULT, a une capacité de 49920 tubes de 1 mL soit 520 rack de 96 tubes. En mettant des tubes plus petits de 300 µL par exemple la capacité est portée à 122800 tubes.

Où sont fabriqués les microtubes 2D de LVL-Technologies ? L’approvisionnement est-il sûr et fiable ?

Les microtubes 2D de la gamme Safe® sont conçus, fabriqués et contrôlés en Europe, dans des environnements industriels maîtrisés répondant aux exigences des applications scientifiques et biotechnologiques.
Cette production européenne garantit une qualité constante, une parfaite traçabilité des lots et une conformité stricte aux standards internationaux.

La maîtrise de la chaîne de production et d’approvisionnement permet à LVL-Technologies d’assurer une disponibilité fiable et durable de ses produits, y compris pour des projets de biobanques à long terme ou des volumes importants.
Cette approche sécurise les utilisateurs face aux risques de rupture d’approvisionnement et garantit la continuité des activités de recherche et de stockage d’échantillons critiques.

Comment gagner en espace de stockage dans mes congélateurs -80 °C ?

Un gain d’espace significatif peut être obtenu en remplaçant des tubes à vissage interne par des microtubes 2D à vissage externe.
Grâce à la conception du bouchon, dont le pas de vis épouse la face supérieure externe du tube, cette configuration permet un gain de hauteur et donc une densité de stockage accrue.
Par ailleurs, le passage de cryoboxes 9×9 ou 10×10 vers un format SBS permet un gain de place supplémentaire tout en ouvrant la voie à une automatisation future de la biobanque.
Enfin, l’intégration du logiciel Hi-Thèque permet d’optimiser régulièrement l’organisation des stocks tout en garantissant une traçabilité complète et sécurisée des échantillons sur place et même à distance.
Nos équipes sont à votre disposition pour vous accompagner dans toutes vos démarches visant à optimiser durablement vos capacités de stockage.

Les microtubes 2D de la gamme Safe sont-ils garantis RNase / DNase free ?

Oui. Les microtubes 2D de la gamme Safe® sont garantis RNase free et DNase free.
Ils sont fabriqués dans des conditions contrôlées et stériles et soumis à des procédures qualité strictes, garantissant leur compatibilité avec les applications de biologie moléculaire, de génomique et le stockage d’échantillons à haute valeur scientifique.

Comment gérer efficacement le rangement de mes microtubes 2D dans des congélateurs -20 °C, -80 °C ou des cuves d’azote liquide ?

Les microtubes 2D de la gamme Safe® sont conçus pour être rangés sur des racks SBS ou cryoboxes standards.
LVL-Technologies propose également des boxes métalliques adaptées et personnalisées, compatibles avec les principaux modèles de réfrigérateurs, congélateurs et cuves d’azote liquide disponibles sur le marché.
L’identification individuelle par code DataMatrix 2D garantit une gestion rapide, fiable et sécurisée des échantillons, facilitant l’inventaire et l’optimisation des espaces de stockage.
Pour une gestion avancée, l’utilisation de systèmes de lecture automatisée et de logiciels de traçabilité est fortement recommandée.

À ce titre, la gamme Safe® de LVL-Technologies intègre une nouvelle génération de lecteurs capables de lire tout type de microtubes 2D, en mode unitaire ou sur racks SBS et/ou cryoboxes 9×9 ou 10×10.

Est-il possible d’évaluer l’inertie chimique du plastique des microtubes 2D vis-à-vis des substances biologiques ?

Oui. Les microtubes 2D de la gamme Safe® de LVL-Technologies sont fabriqués à partir de polypropylène de grade médical (USP Class VI), sélectionné pour sa haute inertie chimique, son très faible relargage et sa compatibilité avec des applications biologiques exigeantes.
Ces matériaux sont parfaitement adaptés au stockage longue durée d’échantillons biologiques sensibles et limitent les interactions avec l’ADN, l’ARN, les protéines ou autres analytes, y compris en conditions d’ultra-basse température sur de longues périodes.
Des tests d’évaluation sur la qualité et la conformité ont été réalisés afin de répondre aux standards des laboratoires de recherche et des biobanques. Les résultats détaillés sont disponibles dans la Technote LVL-Technologies, sur demande.

Que choisir entre le vissage externe ou le vissage interne pour le stockage en ultra-basse température ?

Pour le stockage en ultra-basse température (-80 °C et au-delà), LVL-Technologies recommande l’utilisation de microtubes 2D à vissage externe.
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Cette configuration réduit significativement la surface de contact entre l’échantillon et la partie interne du bouchon, limitant ainsi les risques de contamination croisée, de transfert de matière ou d’interactions physico-chimiques indésirables.
Ces risques sont particulièrement accrus avec les tubes à vissage interne lors de phases d’agitation ou de centrifugation, où les échantillons liquides peuvent remonter et stagner le long du pas de vis interne.
Une étude comparative détaillant ces phénomènes est disponible dans la Technote LVL-Technologies, accessible à l’ensemble de nos utilisateurs sur demande, en version papier ou électronique.